金苑种业做现代企业制度的践行者，建立完整的组织结构和完善的制度体系，实现从研发、生产、加工、质检、营销到行政、财务的管理流程化、标准化、和自动化，实现企业高效的运行管理。
实施了企业研发管理信息系统、产品生产可追溯管理系统、企业行政管理办公自动化(OA)管理系统、企业财务ERP系统;实现了从研发、加工生产、日常内部决策与控制、企业资源管理等全方位的信息化、规范化、自动化、科学化和可追溯，实现了物流、信息流、决策流、控制流、财务流五流统一，提高了效率、效果;在公司制度化建设的基础上，加强文化建设，突出人才队伍建设，不断创新管理方法，高效的运行管理提升了企业安全、高效可持续发展能力。